Nejlepší psi pro introverta
10 nízkoúdržbových psích plemen pro zaneprázdněné majitele
10 nejlepších psích plemen pro ochranu
10 nejlepších plemen psů pro první majitele

Testování DNA u psů smíšených plemen

[Aktualizováno 10. ledna 2019]

Sekvenování psího genomu, uskutečněné jako veřejný výzkumný projekt v roce 2004, otevřelo stavidla nekonečným možnostem genetického testování psů. Svatým grálem pro mnoho vědců zabývajících se touto prací je pochopení a nakonec i odstranění dědičných psích chorob. Pro mnoho majitelů psů je však nejzajímavějším výsledkem této seriózní práce možnost, že se mohou přesně naučit, z jakých plemen jsou jejich mutts vyrobeni.

Ačkoli již existuje několik komerčních společností, které nabízejí produkty, které mají být schopny právě toto, naše hodnocení testů identifikace plemen je, že výsledky mohou být stejně smíšené jako psi, které se snaží vysvětlit. Výsledky testů mohou být téměř tak rozmanité, zajímavé a zábavné jako naši přátelé ze smíšených plemen, ale zdá se, že alespoň v současnosti nemusí být schopni zcela uspokojit otázku původu vašeho vraha. Testy se však každým dnem zlepšují! A jak roste porozumění DNA, velikost vzorových databází a výkon počítačů, je pravděpodobné, že testy v určitém okamžiku skutečně splní marketingový humbuk, který se v současnosti používá k jejich prodeji.

Testování DNA u psů smíšených plemen

Testy psích plemen:Historie

První test DNA smíšeného plemene se zrodil v laboratoři Elaine A. Ostrander, Ph.D., a Leonida Krugylaka, Ph.D., když byli ve Fred Hutchinson Cancer Research Center v Seattlu. Dr. Ostrander a Krugylak hledali genetické společné rysy mezi čistokrevnými psy uznanými American Kennel Club (AKC). Jedním z cílů bylo objevit geny zodpovědné za nemoci společné jak psům, tak lidem, včetně několika typů rakoviny. Také studovali příbuznost asi 100 plemen uznaných AKC; to vedlo k objevu, že genetická variace mezi plemeny psů je mnohem větší než variace uvnitř plemen. Pro srovnání, genetická variace mezi lidskými populacemi je asi 5,4 procenta; u psů zjistili, že variace mezi plemeny se odhaduje na 27,5 procenta.

V roce 2005 podepsali Ostrander a Krugylak dohodu o komercializaci s Mars Veterinary™, nově vytvořenou divizí mocné Mars, Incorporated (ano, myslím bonbóny, žvýkačky, krmivo pro domácí zvířata a další krmiva), licencující technologii, kterou vyvinuli pro použití v chovu. identifikace.

Mars Veterinary nebyl sám v závodě o uvedení produktu na identifikaci plemene. Vědci z MMI Genomics Inc. (MMIG) také studovali psí DNA. Ve skutečnosti MMIG poskytoval služby ověřování identity a původu pro AKC, United Kennel Club (UKC), Professional Kennel Club (PKC) a řadu dalších kynologických registrů a klubů plemen. MMIG byla původně divizí Celery a vedla soukromé úsilí o sekvenování psího genomu. V březnu 2007 byla také první, která komerčně uvedla na trh test identifikace plemene. MMIG nazvala svůj produkt Canine Heritage™ Breed Test. Když měl test svůj komerční debut, byl potenciálně schopen identifikovat pouze 38 plemen; test („XL“) byl aktualizován v polovině roku 2008, aby identifikoval více než 100 plemen.

Testování DNA u psů smíšených plemen

Mars Veterinary uvedl svůj test na trh jen o několik měsíců později, v září 2007, jako Mars Veterinary Wisdom Panel™ MX test.

Jak fungují testy DNA psů?

Každá společnost propaguje své testy tím, že uvádí, že jsou dobrým způsobem pro majitele psů smíšených plemen, jak zjistit, zda jeho pes může být náchylný k určité geneticky podmíněné chorobě, pokud pes má plemena, o kterých je známo, že zdědí určité podmínky. Také říkají, že testy pomáhají s výcvikem tím, že dávají majiteli nahlédnout do chování psa; důvod, proč se pes chová tak, jak se chová, lze vysvětlit jeho původem. Zástupci společnosti však nakonec přiznávají, že většina jejich zákazníků si testy kupuje jednoduše ze zvědavosti a protože je to baví.

Testy DNA, na které jsme se podívali, čerpají své databáze z více než 160 plemen uznaných AKC a týkají se pouze plemen nalezených v Severní Americe. Na celém světě se odhaduje, že existuje více než 300 plemen psů.

Testy využívají genetické nástroje označované jako „markery“ k definování pojmu plemeno psa. Genetický marker je pozice v genomu, kde existuje variabilita v sekvenci, která se dědí, podle pravidel klasické genetiky. Dva běžné druhy markerů jsou mikrosatelity a jednonukleotidové polymorfismy (SNP).

Každá společnost nezávisle vyvinula sadu markerů, které definují plemena ve svých databázích, a využívá sofistikované počítačové algoritmy, aby porovnala DNA daného smíšeného psa s DNA ve své databázi, aby pro něj našla nejlepší shodu plemen. Analýza určuje, jak blízko a do jaké míry se genetické vzory psů smíšeného plemene shodují s genetickými vzory čistokrevných.

Na trhu v USA jsou dva velmi významní hráči (MMIG a Mars Veterinary) a několik z nich se snaží získat větší roli. EDP ​​BioTech Corp. je velmi nová; čtvrtá společnost, DNA Diagnostics Center Veterinary, zadává svou práci společnosti EDP BioTech Corp. Existuje alespoň jeden test (Viaguard DNAffirm™) nabízený kanadskou společností Accu-Metrics Ltd., který jsme nezkoumali.

Mars Veterinary Wisdom Panel™

Wisdom Panel MX byl jediný test DNA smíšeného plemene, který vyžadoval vzorek krve. Zpočátku byl test k dispozici pouze prostřednictvím veterinářů, nyní je nyní dostupný online přímo od veterináře Mars, stejně jako u veterinářů a vybraných prodejců chovatelských potřeb. Má doporučenou maloobchodní cenu 125 USD, která zahrnuje dopravu zdarma, pokud si objednáte přímo od veterinářů Mars. Přesto je stále nutná návštěva veterináře vašeho psa kvůli odběru krve, což znamená dodatečné náklady na návštěvu veterinární ordinace a proceduru a možný stres pro vašeho psa, pokud nemá rád veterinární ordinaci.

AKC uznává 161 plemen; databáze Mars Veterinary obsahuje ve své databázi 153 plemen AKC plus čtyři plemena čekající na uznání od AKC, celkem 157 plemen. Při vývoji své databáze Wisdom Panel během vývoje testu zadal více než 13 000 psů a dokončil více než 19 milionů analýz genetických markerů. Databáze Mars Veterinary je největší ze všech tří společností, které jsme zkoumali, ale její test je také nejdražší.

Po extrakci DNA ze vzorku krve jsou identifikovány jednotlivé SNP – nebo mírné odchylky v složení DNA. Test testuje 321 bodů nebo značek, kde jsou nalezeny odchylky, a snaží se vytvořit vzory specifické pro plemeno. Na datech je pak spuštěn proprietární algoritmus.

Angela Hughes, DVM, veterinární genetička a konzultantka pro Mars Veterinary, to vysvětluje tím, že počítač pak „řekne“, když se dívá na DNA konkrétního psa:„Pokud bych jí měl udělat jednu věc, co by bylo nejlepší? zápas? Když dva, co by odpovídala, pak tři, pak tak dále, až osm. Výsledkem je pak statistické skóre pro každý „strom“, který program sestaví, podle toho, jak se daný pes nejlépe shoduje.“ Osmička je magické číslo, protože úroveň spolehlivosti Mars Veterinary má sahat o tři generace zpět (osm praprarodičů).

Společnost tvrdí, že test určuje složení plemene s 90procentní přesností, což definuje jako ověřovací testování, jehož výsledkem je průměrná přesnost 90 procent u kříženců první generace psů známého původu (náš důraz).

Stejně jako u konkurenčního testu Canine Heritage jsou výsledky Panelu moudrosti uváděny ve třech kategoriích, pouze Mars Veterinary je nazývá Významná, Středně pokročilá a Menší plemena, zhruba v překladu rodiče, prarodiče a praprarodiče. Aby bylo plemeno uvedeno jako významné, musí alespoň 50 procent DNA psa pocházet z tohoto plemene (tj. jeden z rodičů byl čistokrevný nebo případně oba prarodiče byli stejného plemene); Střední, alespoň 25 procent; a Minor, alespoň 12,5 procenta.

Mars Veterinary očekává, že pokud váš pes vykazuje významné plemeno, pravděpodobně bude vykazovat některé fyzické a behaviorální rysy tohoto plemene, pokud některé geny nejsou recesivní. U středně pokročilého „můžete“ u svého psa vidět některé fyzické a behaviorální rysy tohoto plemene a u Minor je nepravděpodobné, že fyzické rysy tohoto plemene jsou u psa vizuálně znázorněny, pokud některé geny nejsou dominantní.

Společnost uvádí dvou až třítýdenní obrat na výsledky testů; stav testu lze sledovat online – a jakmile budou výsledky připraveny, budou zaslány klientovi poštou, ale budou k dispozici online dříve. Jediným kontaktním údajem společnosti, který je nabízen na webových stránkách, je e-mailová adresa; jakkoli je to neužitečné, webová stránka sama o sobě nabízí spoustu informací.

Když jsme našli telefonní číslo, na které jsme se mohli obrátit, zástupce, který odpověděl, byl mírně nápomocný, i když byl více připraven jednat s někým, kdo zavolal a prodiskutoval výsledky testů jejich psa, než s někým, kdo hledá podrobné informace o společnosti a jejích produkty.

Podívejte se na produkty Wisdom Panel zde.

BioPet Vet Lab / PooPrints

Posledním vstupujícím na trh je DNA Breed ID Test nabízený BioPet Vet Lab, divizí EDP Biotech Corp. Samotná BioPet Vet Lab byla vytvořena koncem roku 2007; její psí test DNA byl spuštěn na začátku roku 2008 prostřednictvím online prodejců. Kromě testu ID plemene nabízí BioPet také testování DNA proof-of-Parentage, DNA ID zvířete a velmi zajímavý program PooPrints™ („srovnejte nepořádek přes DNA“).

Cílem společnosti je nabídnout spolehlivý a cenově dostupný test. Doufá, že toho dosáhne omezením počtu plemen ve své databázi na 63 – což společnost tvrdí, že představuje „asi 93 procent psí DNA, která je v USA podle historických trendů v popularitě plemen“ – a stanovení ceny testu na 60 USD. . Přidání dalších plemen vyžaduje přidání více markerů, což zvyšuje náklady; BioPet naznačuje, že s největší pravděpodobností doplní svou databázi na 65 až 70 plemen. Tento test také používá výtěr z tváře ke sběru DNA psa.

Společnost prodává své testy prostřednictvím PetSmart, Pet Supermarket, dalších maloobchodníků a online prodejců. Obrat pro výsledky je zhruba dva týdny a nezdá se, že by společnost měla možnost online sledování stavu testu. Na požádání znovu provedou test, přičemž připouštějí možnost lidské chyby, ale mluvčí společnosti Meg Retinger uvedla, že ani v těch, které opakovali, nikdy neviděli výsledek testu, který by byl při druhém spuštění úplně jiný. Webová stránka BioPet má mírné množství informací a mluvčí společnosti byl nápomocný.

Spokojení spotřebitelé testů DNA psů smíšených plemen

Ruby, pojmenovanou podle svého krátkého červeného kabátku, přivezl domů Rosalie a Leonard Sanchezovi z Riverside v Kalifornii jejich 15letý vnuk, který ji dostal od paní, která rozdávala štěňata ze zadní části dodávky. Paní řekla jejich vnukovi, že to štěně je svatobernardský mix. Rosalie jeho slova rychle zavrhla a usoudila, že si onen díl příběhu vymyslel, protože Ruby nevypadala jako svatý Bernard.

Začátkem tohoto roku se dozvěděla o testu Canine Heritage a byla zvědavá dozvědět se více o Rubyině pozadí. Ona a její manžel hádali, že Ruby byla součástí boxera. Jejich veterinář souhlasil, protože Ruby měl velké tlapy; jeho odhad byl boxer/doga nebo boxer/mastiff.

Když se vrátily výsledky, Rosalie měla podlahu; její vnuk měl nakonec pravdu! Test ukázal Boxera a svatého Bernarda. Přestože stále nemůže přijít na to, že Ruby nepřipomíná svatého Bernarda, Rosalie říká:„Pes smíšeného plemene je jako bonboniéra. Nikdy nevíte, co je uvnitř.“

Přítelkyně Dana McCarthyho našla Floru ležet vedle autobusové zastávky, vyhublou a pokrytou blechami. Jejich veterinář si myslel, že Flora je směs labradora a špringršpaněla, ale byla malá, ve dvou letech vážila 30 liber. Jiní lidé hádali Border Collie a Jack Russell Terrier.

Dan, obyvatel Hollywoodu v Kalifornii, chtěl vědět o Floře co nejvíce. „Chci vědět, kdo byli její matka a otec, kde jsou teď, a ukázat jim, že Flora vyrostla ve skvělého psa se skvělým životem,“ říká. Loni v létě nařídil test Canine Heritage. Výsledky ukázaly, že Florini rodiče pravděpodobně nebyli čistokrevní – nic nebylo uvedeno v kategorii Primární, přesně jak Dan předpokládal. Sekundární úroveň však hlásila německého ovčáka a kokršpaněla. Dan byl ohromen. "Španělka vysvětluje, proč je tak malá, a ovčák vysvětluje, proč je tak chytrá!"

Kitty Cannon z Crystal Beach na Floridě a její manžel vždy hráli hádanku o líčení jejich psího plemene. Když se Kitty v roce 2008 dozvěděli o testování DNA, pomyslela si:„Proč ne? Protože si nemůžeme dovolit nechat Foxe klonovat, možná když budeme znát jeho plemena, můžeme v budoucnu hledat dalšího skvělého psa s jeho vlastnostmi." Hádali, že Fox je částečně kolie nebo šeltie. Když se jejich výsledky Canine Heritage vrátily, byli překvapeni, že bernského salašnického psa dostali do sekundární kategorie a čau-čau „In the Mix“. Pouze vyšší bytost by s jistotou věděla, zda jsou výsledky přesné, říká Kitty, „ale všimli jsme si jistých podobností, pokud jde o to, kde získal barvu srsti, tvar uší a linii tlamy. Víme, že s ním rozbili formu a už nikdy nebude.“

Evelyn Orenbuch, veterinářka z Philadelphie, objednala Mars Veterinary Wisdom Panel MX pro svého záchranářského psa Pia. „Chtěl jsem vědět, jestli má Piino chování něco společného s plemeny, o kterých jsem si myslel, že má v sobě. Hádali jsme border kolii, vipeta a…? Výsledky se shodovaly pouze na nejnižších úrovních a odhalily německého ovčáka a několik dalších plemen. Doktorka Orenbuchová byla poněkud zklamaná, protože doufala, že bude mít více informací o Piině původu. Přesto říká, že by test klientům doporučila. „Vědět, jaká plemena jsou u vašeho psa, vám pomůže porozumět jeho emocionálním a fyzickým aspektům. Nemusí to změnit to, co se svým psem děláte nebo jak se k němu chováte, ale může vám to pomoci mu porozumět.“

Kritika a omezení testování plemen

Wisdom Panel (Mars Veterinary product) byl kritizován, protože vyžaduje cestu k veterináři a odběr krve. To zvyšuje náklady na testování a mohlo by to stresovat psy, kteří nemají sklon k veterináři. Kritici také naznačují, že vzorky krve mohou být při přepravě do laboratoře poškozeny.

Mars Veterinary obhajuje své rozhodnutí použít krev vysvětlením, že DNA ze vzorku krve je „zlatým standardem“, protože kvalita a množství získané DNA je lepší než z bukálního (lícního) výtěru. Dr. Hughes z Mars Veterinary říká, že DNA v krvi je ve skutečnosti velmi odolná a ve skutečnosti musí laboratoř během analýz SNP opakovaně zvyšovat teplotu DNA téměř k varu. Společnost také používá speciálně navržené plastové trubice k ochraně krevní trubice při přepravě.

Testy výtěru z tváře mají svou vlastní kritiku. Bukální výtěry mají vyšší poruchovost kvůli změnám ve vzorkování vlastníkem, jako je například neodebrání dostatečného množství buněk. Také kvůli bakteriím v tlamě psů existuje potenciál pro růst bakterií, pokud se vzorky nebudou správně manipulovat.

Pak následuje kritika ze strany spotřebitelů. Jedním opakujícím se tématem nešťastných klientů je, že výsledky testu DNA nedokázaly najít u jejich psů „velmi smíšených plemen“ převahu žádného konkrétního plemene. (Viz sekce níže.)

Další souvisí se skutečností, že někteří psi nevypadají vůbec jako plemena, která jejich testy odhalily. Je těžké mít dobrý pocit z výsledku, který nepotvrzuje ani nevysvětluje nic o fyzickém vzhledu nebo chování psa – a vysvětlení společností pro tento jev může být neuspokojivé.

Web Wisdom Panel říká:„Mnoho částí psího genomu bude pravděpodobně nepozorovatelných nebo skrytých s ohledem na určování vlastností. To se může stát pro libovolný počet genů určujících vlastnosti. Jednoduše řečeno, pes smíšeného plemene může být směsí tří nebo čtyř plemen, ale má jen málo znaků patrných z jednoho nebo více těchto plemen.“

MMIG’s vysvětluje:„Canine Heritage Breed Test funguje pouze pro plemena, která byla ověřena. Pokud složení plemen vašeho mazlíčka obsahuje nevalidovaná plemena (plemena), test může identifikovat plemena dříve v původu vašeho psa. To může způsobit identifikaci zjevně nepravděpodobných plemen pro složení vašeho mazlíčka." Jak platné jsou výsledky?

Abychom získali určitou perspektivu od nezávislého odborníka na psí DNA, vyzpovídali jsme Beth Wictum, ředitelku Veterinary Genetics Laboratory na University of California-Davis School of Veterinary Medicine. Wictum působí na univerzitě 30 let. Účastnila se a byla svědkem vývoje vědy, která umožňuje identifikovat zvíře prostřednictvím studia jeho tkáně; během jejího funkčního období se „moderní stav“ změnil od stanovení krevní skupiny k sekvenování genomu.

Wictum, když byl požádán, aby se vyjádřil k testům ID smíšených plemen, zdůraznil, že testy jsou jen tak dobré jako databáze každé společnosti; to znamená, že pokud plemeno není zastoupeno v databázi společnosti, pak test určí další nejbližší shodu. Vysvětluje to tím, že čistokrevní psi, zejména registrovaní čistokrevní psi, byli intenzivně řízeni a mají omezený genetický fond.

"Většina plemen byla vytvořena intenzivní selekcí během posledních několika set let, takže nebylo dost času, aby se rozcházela prostřednictvím mutací," říká. Rozdíly mezi plemeny spočívají v selektivním šlechtění chovateli na morfologii (strukturu) nebo chování. Ideální test plemene by proto byl takový, který by se zabýval těmi vlastnostmi, které charakterizují každé plemeno a činí je jedinečnými.

„Obor psí genetiky je stále mladý; psí genom byl sekvenován teprve před pěti lety,“ říká. "Právě začínáme identifikovat geny odpovědné za různé vlastnosti."

Stejně jako mnoho vědců v této oblasti je i Wictum nadšený z potenciálu pro identifikaci genetického základu pro různé nemoci. Říká, že Veterinární genetická laboratoř na UC Davis a Bannasch Laboratory (také na UC Davis) „identifikují genetický základ různých onemocnění, které pak mohou být nabízeny jako testy veřejnosti. Pokud víte, jaká onemocnění se mohou objevit, budete moci nechat svého mazlíčka otestovat, abyste zjistili, zda je nositelem mutace.“

Její rada ohledně testů DNA smíšených plemen? "I když tyto testy mohou naznačovat plemena, která přispěla ke genetické výbavě vašeho mazlíčka, musíte si uvědomit, že nejsou 100% přesné - a nemyslím si, že by to tak tvrdily." Pokud máte peníze na utrácení a chcete to dělat jen pro zábavu, pak rozhodně jděte do toho.“

Někteří majitelé říkají, že testování plemen se nevyplatí

Laura Pescador z Denveru v Coloradu objednala v květnu 2008 test Canine Heritage pro Mishu, její „60kilovou, černohnědou, hranatou, krátkosrstou, s velkýma ušima, hlubokým hrudníkem a bi-eyed mystery mixem“. Laura cítila, že kombinace plemen, které jí bylo řečeno, když adoptovala Mishu, je nepravděpodobná (australský ovčák/labradorský retrívr); také doufala, že dostane kus papíru, který říká, že Misha není pitbull-mix, "Ne proto, že bych je neměl rád, ale kvůli legislativě mého města specifické pro plemeno." Laura byla zklamaná, když obdržela „omluvný dopis“ s výsledky uvádějícími, že test byl neprůkazný! Na jejím certifikátu bylo vedle „Primární“ napsáno „Netestované plemeno“, zatímco ostatní dvě kategorie byly prázdné.

Scamper, Monty a Rainey jsou tři psi smíšených plemen patřící veterináři J.C. Burchamovi z Olathe, Kansas. Na začátku roku 2008 předložila vzorky krve pro každého psa testu panelu moudrosti. Dr. Burcham si byl docela jistý, že Monty byl „několik generací mutts, kteří se množili na mutts“ a měl od svých výsledků jen malá očekávání. Scamperovi říká mix Jack Russell/Basenji/Beagle, takže jsem čekala, že uvidím něco takového, nebo dokonce nějaké plemeno teriéra. Rainey byla nalezena jako štěně na venkově ve Virginii, kde zemřela hlady se dvěma sourozenci, z nichž všichni tři vypadali jako border kolie.

Když přišly výsledky, Dr. Burcham byl zklamaný. „Měl jsem pocit, že to byly úplně vyhozené peníze! Rainey je jednoznačně součástí border kolie a to byl asi jediný spolehlivý výsledek, který jsem viděl. Bylo zjištěno, že dva z mých tří psů jsou „příliš složití“ na identifikaci. Mohl jsem ti to říct! Proto jsem za test zaplatil." Raineyho výsledky ukázaly „nějakou“ border kolii; ukázala však vzdálené stopy po Briardovi, Cairn teriérovi, německé dogy a keeshondu. Montyho test odhalil vzdálené stopy aljašského malamuta, bígla, vousaté kolie, čau čau a hladkého foxteriéra, zatímco test Scamper ukázal stopová množství briarda, kadeřavého retrívra a shetlandského ovčáka.

Primárním zklamáním doktorky Burchamové bylo, že viděla Briarda ve dvou svých psech, což bylo podle jejího názoru nepravděpodobné. Také jí vadilo, že Scamper a Monty byli přezdíváni „extrémně složití psi smíšené rasy“. Vzhledem k tomu, že pouze 10–15 procent psů smíšených plemen spadá do této kategorie (podle Mars Veterinary), jak by je mohla mít dva?

Sdílel jsem zklamání doktorky Burchamové s doktorkou Hughesovou, veterinární konzultantkou Marsu, a ona mi nabídla, že se na ty tři testy nejen podívá, ale také je zopakuje. V roce od Dr.
Burcham odeslal vzorky, do databáze Mars Veterinary bylo přidáno 23 dalších plemen a její algoritmy byly upraveny. Společnost zjistila, že program rozděluje psy na mnoho malých kousků, „ztrácí les mezi stromy“, což vede k některým falešným pozitivům. Výsledky jsou nyní typicky menší počet plemen a potenciálně ve větším „množství“.

Když Raineyho test proběhl znovu, Briard a Cairn Terrier se neobjevili; s největší pravděpodobností byly falešně pozitivní. Border kolie dosáhla úrovně signifikant (rodič) a německá doga a keeshound se objevili na úrovni střední (prarodiče). Montyho výsledky ukázaly, že se Beagle a Chow posunuli na střední (prarodičskou) úroveň; ostatní plemena byla stále evidentní, ale nebylo možné je s jistotou označit, takže byla pravděpodobně falešně pozitivní v prvním testu.

Scamperovy nové výsledky stále odhalily „velmi smíšeného psa“. Curly-Coated Retriever se posunul na úroveň Intermediate (prarodiče) a zlatý retrívr se objevil na úrovni Minor. Briard a Sheltie byli potenciálně součástí její vzdálené historie nebo falešně pozitivních výsledků. Byl také zjištěn anatolský ovčák a australský honácký pes, které Dr. Hughes považoval za pravděpodobnější než Briard a Sheltie.

Nancy Kerns váží

Samozřejmě, když autorka Lisa Rodier navrhla myšlenku napsat článek o zkouškách identifikace smíšených plemen, [ chtěla nechat otestovat mého smíšeného psa Otta – víte, jen kvůli žurnalistice! Ale jaký test si máme objednat, od jaké firmy? Rychle jsme se rozhodli objednat nejrozsáhlejší produkt od každé ze dvou předních společností v oboru a porovnat výsledky.

Otto měl schůzku s veterinářem, kterou jsem využil jako příležitost nechat mu odebrat krev pro Mars Veterinary Wisdom Panel. Dodrželi jsme normální protokol:zaplatil jsem veterináři za odběr krve a test; jeho zaměstnanci odeslali vzorek do laboratoře a dali mi identifikační číslo testu, abych mohl zkontrolovat průběh testu pomocí webu Wisdom Panel.

Následující den jsem přivedl Ottu s sebou do PETCO, abych si koupil testovací sadu pro test Canine Heritage „XL“ MMIG (tuto společnost od té doby koupil Wisdom Panel). Zaměstnanci oddělení péče o srst PETCO byli vyškoleni společností MMIG k odběru výtěrů z tváří. Po cestě k veterináři předchozího dne byl Otto nervózní, a tak jsem si výtěr z tváře sebral sám (ale požádal jsem pracovníka PETCO, aby zapózoval se vzorkem a jeho poštovní obálkou, víte, pro vědu).

Pozastavení testu DNA

Čekání na výsledky bylo mučivé 7 zvláště od té doby, co mi Canine Heritage poslal e-mail den poté, co jsem odeslal výtěr z tváře, potvrzující jeho přijetí v laboratoři Davis v Kalifornii (bydlím asi 70 mil od Davis). To mě napadlo, že bych mohl brzy obdržet výsledky – ale trvalo celých sedm týdnů, než jsem je dostal poštou! (MMIG říká, že výsledky by se měly dostavit za šest až osm týdnů; bylo to jen očekávání, kvůli kterému se toto čekání zdálo nekonečné. Plus skutečnost, že výsledky nemůžete získat online.) Každý den jsem na webových stránkách kontroloval výsledky Panelu moudrosti. Pouhé tři týdny poté, co si Otto nechal odebrat krev, jsem viděl, že výsledky jsou kompletní, a mohl jsem si stáhnout soubor Adobe Acrobat, který je obsahoval.

Takže? Co je Breed is Otto?

Výsledky panelu moudrosti řekly:"Analýza odhalila, že Otto je poměrně smíšený pes a nenašli jsme důkazy o čistokrevném rodiči nebo prarodiči." (Myslím, že jsem to věděl!) Nebyly nalezeny žádné výsledky na úrovni „Significant“ nebo „Intermediate“. Nicméně na úrovni „Minor“ se objevila tato čtyři plemena:Německý ovčák, *Basenji, *Chow Chow a *Border kolie. Hvězdičky označovaly „Menší množství zjištěno s nízkou spolehlivostí. Tyto výsledky nejsou zahrnuty do výpočtů přesnosti." (Já:"Basenji?!")

Výsledky Canine Heritage neukázaly nic v kategorii „primární“, čau-čau v kategorii „sekundární“ a pudl a border kolie „ve směsi“. (Já:"PUDL?!")

Moje očekávání

Tipoval bych, že Otto má v sobě nějakého německého ovčáka, a dokonce jsem čekal i čau-čau. Rozhodně má ocas typu GSD a jeho uši jsou velmi čau. Když je promočený a jeho vlasy jsou uhlazené, jeho tělo vypadá trochu jako zlatý retrívr. A byl jsem si jistý, že v něm musí být nějaké plemeno teriéra. Jak jinak si vysvětlit ten chlupatý obličej?

Útulek, ze kterého jsem ho adoptoval, odhadl, že je to Airedale a Border teriér. (Dávám jim pokoj; bylo mu jen asi pět měsíců a bylo mu málo, když ho dostali.) Ačkoli se toto plemeno neobjevuje ani v databázi Canine Heritage ani Wisdom Panel, autorka Lisa Rodier fandila pikardiskému ovčákovi (Berger Picard) výsledek; myslí si, že je to zvonař pro psa Winn-Dixie. Nikdo nehádal border kolii, pudla nebo basenjiho.

Proč testy DNA nefungovaly?

Jak mohou mít tyto dvě společnosti pro Otto tak rozdílné výsledky?

O odpověď na tuto otázku jsme požádali Theresu Bradyovou, mluvčí společnosti MMIG. Odpověděla:„Každá společnost vyvinula svůj test nezávisle, takže existuje řada faktorů, které mohou vést k tomu, že u konkrétního psa budou rozpoznána různá plemena. Během výzkumné fáze musí každá společnost identifikovat sadu DNA markerů, které charakterizují rozdíly mezi jednotlivými plemeny. Pak je třeba tyto markery charakterizovat v souboru psů reprezentujících čistá plemena.

„Nejen, že se tyto markery mezi společnostmi liší, ale liší se i počet a zdroj čistokrevných psů. Žádná společnost nemůže otestovat každého čistokrevného psa reprezentujícího plemeno a každá společnost bude mít vyvinutý software, který se používá k porovnání těchto genetických markerů mezi plemeny.

„Některá plemena jsou si však blízce příbuzná, protože vznikla křížením starších, zavedenějších plemen. Například bostonští teriéři byli vyvinuti z křížení anglického buldoka a anglického bílého teriéra. So, depending on the software program, the markers established for the purebreds and the population of breeds in each company’s database, the same dog may test ‘Boston Terrier’ with one company and ‘English Bulldog’ with another.

“Some breeds are related because they arose from a common lineage, such as many of those breeds developed from Asia. Early on, we (MMIG) recognized that the Chow Chow, the Akita, the Siberian Husky, the Chinese Shar-Pei, and even the Shih-Tzu can cluster together as one general breed type so we developed an enhanced program and analysis procedure to split these apart. Thus it is not surprising that the companies may report slightly different results, especially for the breeds that have just a small representation in the mixed breed pet.”

Addressing any results that appear in the “Secondary” section of a report (where they detected Chow Chow in Otto), the MMIG (Canine Heritage) results packet says, “This category reports breeds that might be easily recognizable within your dog. While these breeds may or may not have a strong influence on your pet, each breed listed makes up less than the majority of your dog’s DNA.”

Addressing results that appear in the “In the Mix” section of a report (where they detected Poodle and Border Collie in Otto), the Canine Heritage packet says, “This final category identifies breeds that have the least amount of influence on your pet’s composition. They still appear, at low and measurable amounts, in your pet’s DNA. If your pet’s results only identify breeds in this category, it is possible your pet is composed of so many breeds only small influences from each breed can be detected.”

The Mars Veterinary (Wisdom Panel) results packet explains, “Because of the complexity of genetics and the passing on of dominant and recessive genes from generation to generation, every trait from the breeds we found may not always be visually apparent. It is important to spend time closely observing Otto’s appearance and personality. Think about which of Otto’s traits may reflect a combination of the breeds detected, and which seem to reflect just one of the individual breeds.”

Our Opinion on Breed Testing

I have to say that I found the whole exercise very interesting, but not necessarily worth the cost. Given that the results for my very mixed-breed dog were so weak, the idea that they might help me anticipate certain health or behavior problems linked to the breeds found is not very compelling. But I doubt that’s why most people order the tests; I think most of us are just curious.

Having spent so much time examining and admiring the technological achievements that went into the development of these DNA tests, Lisa Rodier was afraid I would pooh-pooh the science behind these tests because I was so skeptical of the breeds detected in Otto’s lineage. It’s not that; I trust the science. I believe there are traces of these breeds (and many others) in Otto. It’s just that I already knew he was a very mixed dog, just from a (free!) look at him. And if he wasn’t such a mixed bag – if he looked a lot like one particular breed, I’d probably be satisfied with the idea that he was mostly that breed; I wouldn’t spend $100-plus to confirm it.

That said, I must admit I will be interested to see how the results might change in a few years, after these companies put thousands and thousands more dogs into their databases. Which breeds will “fall off” of Otto’s results as meaningless “background noise”? Will the Picardy Shepherd be added? It could still develop that Otto is a limp-eared Picardy who fell out of a French tourist’s car somewhere in the Northern California wine country…We’ll check back with these companies in a few years, and let you know.

– Nancy Kerns

Dog DNA Testing FAQs

Canine mixed breed tests seem to be a very emotional topic. Those who have used the tests and have gotten the results they expected tend to be proponents, while those who received weak results or results that didn’t seem to square with the dog’s appearance tend to regret the purchase. But does that mean the tests don’t work? Here’s a stab at trying to explain some of what might be going on.

Breed results are reported in levels; Why is my dog only getting “minor” or “trace” breeds and no strong hits?

Dr. Hughes explained that most likely the dog’s parents and grandparents were themselves mixed breed, and a portion of the dog’s ancestry can be mixed beyond three generations which, for Mars Veterinary, is the extent of the company’s confidence. There is also the possibility that a breed is not covered in the database (for example, none of the tests’ databases include Rat Terrier) so the test will look for the most closely related breed.

My dog looks like X, but the test says she’s Y…

Dr. Hughes explains that we want to associate a particular trait with one breed, but in actuality, it could be coming from a number of breeds. And when we move across breeds, combinations of genes can create very unusual outcomes.

One way she looks at the issue is first looking at a dog’s traits, defining what genes are necessary to get those traits, and then asking whether we can get those genes in a particular breed? For example, the merle color pattern, very common in Australian Shepherds, comes from a single gene, and a dog need only have one copy of that gene to exhibit that color pattern, And guess what? Dachshunds, Chihuahuas, and Great Danes can all provide that gene.

Black and tan coats are commonly associated with Rottweilers and Dobermans. But Chihuahuas, Cocker Spaniels, Dachshunds, and Poodles all carry this gene mutation. But in this case, it is recessive, so two copies must come together for

us to actually see that color pattern.

Meg Retinger of BioPet also points out that in some very mixed dogs, you might only see very subtle traits, such as the shape of the ear or the eyes. Her son’s dog tested as showing Beagle, yet she looks very much like a Labrador. When she howls, however, she sounds like pure Beagle!

My dog is a Labradoodle (Labrador Retriever-Poodle cross), so why doesn’t the test say she’s a 50/50 mix?

We let Theresa Brady of MMIG address this, as she herself owns a Labradoodle. When she tested her dog using the Canine Heritage test, the results showed that Poodle was a Secondary breed, with Labrador Retriever “In the Mix.”

She explains, “You should know that my dog came from a breeder who claimed that the dog was seventh generation Labradoodle, which means that neither of her parents was a purebred (purebred Poodle or Retriever) and neither of their parents were purebred and so on. It makes sense, then, that she had nothing show up in Primary.” When I asked why the Poodle was Secondary, but not the Retriever, her guess was that the breeder probably crossed back more Poodle, looking for a more hypoallergenic coat. Dr. Hughes adds, “When breeding Labradoodle to Labradoodle, the “amount’ of Lab or Poodle genes passed down is random chance (think of a Pachinko machine). Testing the dog’s littermates may show very different proportions of each of these breeds. That being said, some ‘Labradoodle’ breeders are back-crossing Labradoodles to Poodles to change the size or coat of the dogs. I have seen some really strange looking Labradoodles!”

How can dog DNA tests get better?

Increasing the size of the database, increasing the number of markers, and overall innovations in technology will see the tests become better tools. Also, as research continues on canine genetics, a better understanding of genes and how they relate to various breed traits will play a role in making a better test.

Lisa Rodier lives in Alpharetta, Georgia, with her husband and two Bouviers.